El archipiélago que compone a Puerto Rico está situado en el Caribe Occidental. Puerto Rico, la más pequeña de las Antillas Mayores, es una isla de forma casi rectangular, con una superficie de alrededor de 3,435 millas cuadradas (cerca de 9,000 kilómetros cuadrados). El dato común de que la Isla mide 100 millas de este a oeste y 35 de norte a sur, es un estimado aceptable, aunque en realidad se refiere a millas náuticas que son un poco más largas que las millas terrestres. Utilizando un mapa digital y un programa cartográfico se estima que la isla de Puerto Rico mide 110 millas terrestres de oeste a este (desde Punta Higüero en Rincón hasta Punta Puerca en Ceiba) y alrededor de 39 millas terrestres de norte a sur (desde Quebradillas hasta Guánica). Los terrenos montañosos (lomas, colinas y montañas) ocupan poco más de un 60% de su superficie. El punto más alto está en el Cerro Punta en la Cordillera Central (precisamente en el área entre Jayuya y Ponce) y mide 1,338 metros sobre el nivel del mar (4,400 pies, aproximadamente).

Puerto Rico cuenta con una red hidrográfica muy densa de alrededor de 800 corrientes de agua superficiales. De éstas, las más caudalosas se encuentran en la zona norte del país debido a la composición montañosa (más extensa de norte a sur), como también al factor de la llegada del viento marino proveniente del anticiclón de Bermuda al norte de Puerto Rico. Esto a su vez hace que la costa sur sea más seca y cálida que las costas este, norte y oeste.

La temperatura media anual es de 80 grados Fahrenheit (26º centígrados). El punto con las temperaturas más bajas se encuentra alrededor de la Represa el Guineo (ubicado en el Bosque Toro Negro, entre Ciales y Orocovis). La media anual para este punto es de 67º Fahrenheit. La temperatura media más alta se registra en Guayama, al sudeste de la Isla con 81º Fahrenheit. La media anual de precipitación para Puerto Rico es de 69 pulgadas.